Threatened_Species_Rmarkdown
Samuel Wolf
May 11, 2018
library(rredlist)
library(tidyverse)
library(foreach)
library(dismo)
library(speciesgeocodeR)
library(taxize)
library(cellranger)
library(maptools)
library(RColorBrewer)
library(ggplot2)
library(knitr)
library(kableExtra)
library(leaflet)Correlation between life-history traits of Testudines and extinction risk
Introduction
Can the IUCN status of turtles be predicted from their life-history traits? This study also seeks draw the relationship between IUCN status in the order Testudinesa to their geographic range.
Dwindling numbers of terrestrial, riverine and marine turtles signal a threat to biodiversity in global ecosystems. In Asia, traditional medicines and growing meat markets have caused high extinction risks. Of the world’s top 25 endangered tortoises and freshwater turtles, 18 are native to Southeast Asia. (Rhodin et al. 2011) In marine turtles, accounts of decline are largely based on lack of data and have. (Spotila et al. 2000) The high prevalence of threatened turtle species and disparity in data calls for a model that can identiy species at risk of extinction. This study seeks to identify life-history and extinction rate correlates in turtles.
Methods
Amniote Life-History Data
I collected turtle life-history data by downloading the Amniote_Database_Aug_2015.csv life-history database. The amniote dataframe by Myhrvold et al.(2015) included 21,322 objects with 36 variables. I analyzed these data with RStudio using the tidyverse package.
## Read amniote data
Amniote<-read.csv("./Data/Base/Amniote_Database_Aug_2015.csv")
## Since there are many null values in the original data, represented as -999, these should be turned into NA's to make the it more readable.
Amniote[Amniote==-999]<-NABecause most of the dataframe included taxa that were beyond the scope of the question, I refined it to filter information that did not contain information regarding turtle life-history. The new turtle-only dataframe contained 273 observations with 37 variables. From this information we know that we are working with 273 species.
## Filter amniote data to only include testudines
Testudines<-
Amniote %>%
filter(class == "Reptilia" & order =="Testudines")
## Data summary using the kableExtra package
kable(cbind(Testudines), "html") %>%
kable_styling() %>%
scroll_box(width = "500px", height = "500px")| class | order | family | genus | species | subspecies | common_name | female_maturity_d | litter_or_clutch_size_n | litters_or_clutches_per_y | adult_body_mass_g | maximum_longevity_y | gestation_d | weaning_d | birth_or_hatching_weight_g | weaning_weight_g | egg_mass_g | incubation_d | fledging_age_d | longevity_y | male_maturity_d | inter_litter_or_interbirth_interval_y | female_body_mass_g | male_body_mass_g | no_sex_body_mass_g | egg_width_mm | egg_length_mm | fledging_mass_g | adult_svl_cm | male_svl_cm | female_svl_cm | birth_or_hatching_svl_cm | female_svl_at_maturity_cm | female_body_mass_at_maturity_g | no_sex_svl_cm | no_sex_maturity_d |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Reptilia | Testudines | Carettochelyidae | Carettochelys | insculpta | NA | Pig-nosed Turtle, Pitted-Shelled Turtle, Warrajan | NA | 22.500000 | 0.750000 | 16275.00 | 38.40000 | NA | NA | 31.00 | NA | 36.9500 | 69.00 | NA | 38.40000 | NA | NA | 10050.00 | NA | 10050.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Acanthochelys | pallidipectoris | NA | Chaco Side-necked Turtle | NA | 3.500000 | NA | 369.20 | NA | NA | NA | NA | NA | 10.3413 | NA | NA | NA | NA | NA | 369.20 | NA | 369.20 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Acanthochelys | spixii | NA | Black Spine-necked Swamp Turtle | NA | 4.500000 | NA | NA | 8.20000 | NA | NA | NA | NA | NA | 155.50 | NA | 8.20000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Chelodina | canni | NA | Cann’s Snake-necked Turtle | NA | 11.950000 | 2.000000 | 1006.00 | 37.00000 | NA | NA | NA | NA | 7.9500 | 74.00 | NA | 37.00000 | NA | NA | 1006.00 | NA | 1006.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 3652.500 |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Chelodina | expansa | NA | Giant Snake-necked Turtle | NA | 28.000000 | NA | 4744.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 18.3400 | 111.50 | NA | NA | NA | NA | 4744.00 | NA | 4744.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Chelodina | longicollis | NA | Common Snake-necked Turtle | NA | 13.900000 | 2.000000 | 1293.00 | 37.00000 | NA | NA | NA | NA | 7.3000 | 72.50 | NA | 37.00000 | NA | NA | 1293.00 | NA | 1293.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 3652.500 |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Chelodina | mccordi | NA | McCord’s Snakeneck Turtle | NA | 6.500000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 99.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Chelodina | novaeguineae | NA | New Guinea Snake-necked Turtle | NA | 11.950000 | 2.000000 | 1006.00 | 37.00000 | NA | NA | NA | NA | 7.9500 | 74.00 | NA | 37.00000 | NA | NA | 1006.00 | NA | 1006.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 3652.500 |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Chelodina | oblonga | NA | North Australian Snake-necked Turtle (siebenorcki: Siebenrock’s Snake-necked Turtle; oblonga: Narrow-breasted Snake-necked Turtle) | NA | 9.750000 | NA | 1174.75 | 4.40000 | NA | NA | NA | NA | 13.1300 | 165.00 | NA | 4.40000 | NA | NA | 1174.75 | NA | 1174.75 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Chelodina | parkeri | NA | Parker’s Snake-necked Turtle | NA | 9.000000 | NA | 1065.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 12.0000 | 95.00 | NA | NA | NA | NA | 1065.00 | NA | 1065.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Chelodina | reimanni | NA | Reimann’s Snakeneck Turtle | NA | 11.950000 | 2.000000 | 1006.00 | 37.00000 | NA | NA | NA | NA | 7.9500 | 75.00 | NA | 37.00000 | NA | NA | 1006.00 | NA | 1006.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 3652.500 |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Chelus | fimbriatus | NA | Mata Mata | NA | 12.000000 | NA | 4407.00 | 35.80000 | NA | NA | NA | NA | 28.8110 | 200.00 | NA | 26.00000 | NA | NA | 5000.00 | NA | 5000.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Elseya | albagula | NA | White-throated Snapping Turtle | NA | 5.000000 | NA | 4295.00 | 21.80000 | NA | NA | NA | NA | 15.7000 | 160.00 | NA | 21.80000 | NA | NA | 4295.00 | NA | 4295.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Elseya | dentata | NA | Northern Australian Snapping Turtle | NA | 5.000000 | NA | 4295.00 | 21.80000 | NA | NA | NA | NA | 15.7000 | 160.00 | NA | 21.80000 | NA | NA | 4295.00 | NA | 4295.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Elseya | irwini | NA | Irwin’s Turtle | NA | 5.000000 | NA | 4295.00 | 21.80000 | NA | NA | NA | NA | 15.7000 | 160.00 | NA | 21.80000 | NA | NA | 4295.00 | NA | 4295.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Elseya | lavarackorum | NA | Lavarack’s Turtle | NA | 5.000000 | NA | 4295.00 | 21.80000 | NA | NA | NA | NA | 15.7000 | 160.00 | NA | 21.80000 | NA | NA | 4295.00 | NA | 4295.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Elseya | novaeguineae | NA | New Guinea Snapping Turtle | NA | 6.000000 | NA | 4295.00 | 26.50000 | NA | NA | NA | NA | 15.7000 | 78.00 | NA | 24.15000 | NA | NA | 4295.00 | NA | 4295.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Emydura | macquarii | NA | NA | NA | 13.200000 | 2.500000 | 1740.00 | 20.90000 | NA | NA | NA | NA | 10.0750 | 56.00 | NA | 18.35000 | NA | NA | 1740.00 | NA | 1740.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Emydura | subglobosa | NA | Red-bellied Short-necked Turtle | NA | 8.000000 | NA | 1030.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 8.9200 | 49.00 | NA | NA | NA | NA | 1030.00 | NA | 1030.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Emydura | tanybaraga | NA | Northern Yellow-faced Turtle | NA | 8.000000 | NA | 1030.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 8.9200 | 49.00 | NA | NA | NA | NA | 1030.00 | NA | 1030.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Flaviemys | purvisi | NA | Manning River Turtle, Purvis’ Turtle | NA | 15.500000 | NA | NA | 26.50000 | NA | NA | NA | NA | NA | 69.00 | NA | 26.50000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Hydromedusa | maximiliani | NA | Maximilian’s Snake-headed Turtle | NA | NA | NA | NA | 11.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 11.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Hydromedusa | tectifera | NA | South-American Snake-headed Turtle | NA | 4.000000 | NA | NA | 8.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | 107.50 | NA | 8.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Mesoclemmys | dahli | NA | Dahl’s Toadhead Turtle | NA | 4.000000 | NA | 777.00 | 27.40000 | NA | NA | NA | NA | 15.1600 | NA | NA | 16.15000 | NA | NA | 777.00 | NA | 777.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Mesoclemmys | gibba | NA | Gibba (Toadhead) Turtle | NA | 3.000000 | NA | 706.80 | 6.30000 | NA | NA | NA | NA | 25.8800 | 160.00 | NA | 6.30000 | NA | NA | 706.80 | NA | 706.80 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Mesoclemmys | nasuta | NA | Guianan Toadhead Turtle, Common Toadheaded Turtle | NA | 5.500000 | NA | NA | 13.50000 | NA | NA | NA | NA | NA | 135.00 | NA | 13.50000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Mesoclemmys | tuberculata | NA | Tuberculate Toadhead Turtle | NA | 6.500000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 185.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Mesoclemmys | vanderhaegei | NA | Vanderhaege’s Toadhead Turtle | NA | 4.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 185.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Mesoclemmys | zuliae | NA | Zulia Toadhead Turtle | NA | 7.000000 | NA | 1983.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 18.3000 | NA | NA | NA | NA | NA | 1983.00 | NA | 1983.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Myuchelys | bellii | NA | Western Sawshelled Turtle | NA | 15.500000 | NA | NA | 26.50000 | NA | NA | NA | NA | NA | 69.00 | NA | 26.50000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Myuchelys | georgesi | NA | Bellinger River Turtle, Georges’ Turtle | NA | 15.500000 | NA | NA | 26.50000 | NA | NA | NA | NA | NA | 69.00 | NA | 26.50000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Myuchelys | latisternum | NA | Northern Australian Snapping Turtle, Saw-shelled Turtle | NA | 17.000000 | NA | 1377.00 | 26.50000 | NA | NA | NA | NA | 12.0500 | 69.00 | NA | 16.15000 | NA | NA | 1377.00 | NA | 1377.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Phrynops | geoffroanus | NA | NA | NA | 12.500000 | NA | NA | 37.50000 | NA | NA | NA | NA | NA | 129.50 | NA | 34.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Phrynops | hilarii | NA | Hilaire’s Toadhead Turtle, Hilaire’s Side-necked Turtle | NA | 18.000000 | NA | 2380.00 | 37.50000 | NA | NA | NA | NA | 18.0000 | 83.50 | NA | 34.80000 | NA | NA | 2380.00 | NA | 2380.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Phrynops | tuberosus | NA | Cotinga River Toadhead Turtle | NA | 12.500000 | NA | NA | 37.50000 | NA | NA | NA | NA | NA | 129.50 | NA | 34.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Phrynops | williamsi | NA | William’s Toadhead Turtle, William’s South-American Side-necked Turtle | NA | 9.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Platemys | platycephala | NA | (Western) Twist-neck Turtle | NA | 1.000000 | NA | 325.00 | 20.00000 | NA | NA | NA | NA | 27.0000 | 148.00 | NA | 19.85000 | NA | NA | 325.00 | NA | 325.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Pseudemydura | umbrina | NA | Western Swamp Turtle | NA | 4.500000 | NA | 324.10 | NA | NA | NA | NA | NA | 8.6000 | 180.00 | NA | NA | NA | NA | 324.10 | NA | 324.10 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Rheodytes | leukops | NA | Fitzroy River Turtle | NA | 18.800000 | NA | 1691.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 7.5000 | 47.00 | NA | NA | NA | NA | 1691.00 | NA | 1691.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelidae | Rhinemys | rufipes | NA | William’s Toadhead Turtle, Red-footed Amazon Side-necked Turtle | NA | 7.500000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Cheloniidae | Caretta | caretta | NA | Loggerhead | 3650.000 | 115.000000 | 1.285000 | 109150.00 | 76.00000 | 60.00 | NA | 20.10 | NA | 36.5000 | 57.00 | NA | 37.00000 | 3650.000 | NA | 92400.00 | NA | 92400.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 9642.600 |
| Reptilia | Testudines | Cheloniidae | Chelonia | mydas | NA | Green Turtle | 3650.000 | 112.500000 | 1.030000 | 160000.00 | 75.00000 | 59.00 | NA | 23.90 | NA | 46.9000 | 59.00 | NA | 75.00000 | 3650.000 | NA | 128100.00 | NA | 109409.24 | 45.00 | 55.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 14610.000 |
| Reptilia | Testudines | Cheloniidae | Eretmochelys | imbricata | NA | NA | 6299.720 | 136.050000 | 3.000000 | 67000.00 | 20.00000 | 60.00 | NA | 14.50 | NA | 26.0000 | 60.60 | NA | 20.00000 | 7578.060 | 2.50 | 62300.00 | NA | 86199.05 | NA | 36.30 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 12053.075 |
| Reptilia | Testudines | Cheloniidae | Lepidochelys | kempii | NA | Atlantic Ridley, Kemp’s Ridley Seaturtle | 3835.125 | 110.000000 | 1.370000 | 50000.00 | 76.00000 | 57.50 | NA | 19.60 | NA | 33.9000 | 55.10 | NA | 34.50000 | 3833.875 | 2.00 | 92400.00 | NA | 68500.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6574.320 |
| Reptilia | Testudines | Cheloniidae | Lepidochelys | olivacea | NA | Pacific Ridley; Olive Ridley Sea Turtle | 3652.500 | 110.500000 | 1.340000 | 102000.00 | 76.00000 | 60.00 | NA | 19.85 | NA | 35.3000 | 55.20 | NA | 36.50000 | 3650.000 | 1.00 | 116300.00 | NA | 116300.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 8035.500 |
| Reptilia | Testudines | Cheloniidae | Natator | depressus | NA | Flatback Turtle | NA | 52.800000 | 2.420000 | 74400.00 | NA | NA | NA | 39.30 | NA | 75.2500 | 50.10 | NA | NA | NA | NA | 74400.00 | NA | 74400.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Chelydridae | Chelydra | acutirostris | NA | NA | 3286.080 | 26.450000 | 1.000000 | 5170.00 | 47.00000 | NA | NA | NA | NA | 12.1750 | 77.50 | NA | 39.93333 | 2191.440 | NA | 3875.00 | NA | 4522.50 | NA | 29.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 5844.000 |
| Reptilia | Testudines | Chelydridae | Chelydra | rossignonii | NA | Yucatan Snapping Turtle | 3286.080 | 26.450000 | 1.000000 | 7710.00 | 47.00000 | NA | NA | NA | NA | 12.1750 | 77.50 | NA | 39.93333 | 2191.440 | NA | 3875.00 | NA | 5170.00 | NA | 29.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 5844.000 |
| Reptilia | Testudines | Chelydridae | Chelydra | serpentina | NA | Common Snapping Turtle | 3286.080 | 26.450000 | 1.000000 | 5170.00 | 47.00000 | NA | NA | NA | NA | 12.1750 | 77.50 | NA | 39.93333 | 2191.440 | NA | 3875.00 | NA | 4522.50 | NA | 29.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 5844.000 |
| Reptilia | Testudines | Chelydridae | Macrochelys | temminckii | NA | Alligator Snapping Turtle | 4015.000 | 24.750000 | 1.000000 | 78900.00 | 70.30000 | 120.00 | NA | NA | NA | 32.5800 | 84.00 | NA | 58.80000 | 4015.000 | NA | 23500.00 | 42150 | 99750.00 | 37.50 | 38.80 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 4382.935 |
| Reptilia | Testudines | Dermatemydidae | Dermatemys | mawii | NA | Central American River Turtle | NA | 10.000000 | 3.500000 | 12500.00 | 11.30000 | NA | NA | 31.40 | NA | 40.8000 | 258.50 | NA | 9.70000 | NA | NA | 15660.00 | NA | 9320.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 40.75 | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Dermochelyidae | Dermochelys | coriacea | NA | Leatherback Sea Turtle | 4748.250 | 82.300000 | 5.000000 | 420000.00 | 80.00000 | 60.00 | NA | 46.10 | NA | 81.9500 | 61.00 | NA | 30.00000 | NA | 2.50 | 372500.00 | NA | 372500.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 4930.740 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Actinemys | marmorata | NA | NA | NA | 4.000000 | 1.000000 | 282.00 | 27.30000 | NA | NA | NA | NA | 8.2600 | 80.00 | NA | 27.30000 | NA | NA | 282.00 | NA | 282.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Chrysemys | dorsalis | NA | Southern Painted Turtle | 2556.680 | 6.000000 | 2.000000 | 371.80 | 61.00000 | NA | NA | NA | NA | 5.2950 | 68.50 | NA | 23.30000 | 1642.000 | NA | 378.00 | NA | 395.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 1826.200 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Chrysemys | picta | NA | Painted Turtle | 2556.680 | 6.000000 | 2.000000 | 371.80 | 61.00000 | NA | NA | NA | NA | 5.2950 | 68.50 | NA | 23.30000 | 1642.000 | NA | 378.00 | NA | 395.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 1826.200 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Clemmys | guttata | NA | Spotted Turtle | 2920.000 | 4.290000 | 1.200000 | 165.40 | 30.00000 | 77.00 | NA | NA | NA | 6.6000 | 68.50 | NA | 26.00000 | 2920.000 | NA | 165.40 | NA | 165.40 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Deirochelys | reticularia | NA | NA | 1826.250 | 8.500000 | 2.000000 | 910.50 | 24.00000 | 115.00 | NA | 8.55 | NA | 9.8800 | 89.00 | NA | 24.00000 | 912.000 | NA | 910.50 | NA | 910.50 | 20.95 | 34.60 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Emydoidea | blandingii | NA | Blanding’s Turtle | 6500.000 | 9.600000 | 1.500000 | 1162.00 | 77.00000 | NA | NA | NA | NA | 12.2000 | 72.50 | NA | 44.83750 | 4382.880 | NA | 1162.00 | NA | 1162.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 5113.500 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Emys | orbicularis | NA | European Pond Turtle | NA | 9.000000 | NA | NA | 120.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | 90.00 | NA | 27.90000 | NA | NA | NA | NA | 1000.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 4017.640 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Glyptemys | insculpta | NA | (North American) Wood Turtle | 5840.000 | 8.000000 | 1.500000 | 968.20 | 60.00000 | NA | NA | NA | NA | 13.4900 | 67.00 | NA | 58.00000 | 5840.000 | NA | 968.20 | NA | 968.20 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6574.500 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Glyptemys | muhlenbergii | NA | Bog Turtle | 2900.000 | 3.000000 | 1.000000 | 132.10 | 40.00000 | 65.00 | NA | NA | NA | 4.6400 | 56.00 | NA | 40.00000 | 2545.720 | NA | 132.10 | NA | 132.10 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2191.440 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Graptemys | barbouri | NA | Barbour’s Map Turtle | 6209.080 | 8.500000 | 4.000000 | 1256.00 | 31.70000 | NA | NA | 13.00 | NA | 18.9000 | NA | NA | 18.75000 | 1278.340 | NA | 1256.00 | NA | 1256.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Graptemys | caglei | NA | Cagle’s Map Turtle | NA | 3.500000 | 2.000000 | NA | 14.50000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 14.50000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Graptemys | ernsti | NA | Escambia Map Turtle | 6026.460 | 7.000000 | 4.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 1278.340 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Graptemys | flavimaculata | NA | Yellow-blotched Map Turtle | 3287.160 | 6.000000 | 2.000000 | 918.15 | 36.94167 | NA | NA | NA | NA | 10.1800 | 60.00 | NA | 32.50000 | 1460.960 | NA | 1130.00 | 154 | 918.15 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Graptemys | geographica | NA | Common Map Turtle, Northern Map Turtle | 4382.880 | 12.000000 | 2.000000 | 1138.00 | 19.96667 | NA | NA | NA | NA | 11.2300 | 75.00 | NA | 12.73333 | NA | NA | 1138.00 | NA | 1138.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Graptemys | gibbonsi | NA | Pascagoula Map Turtle, Pearl River Map Turtle, Gibbons’ Map Turtle | 5295.980 | 6.500000 | 2.000000 | 1519.00 | 19.96667 | NA | NA | NA | NA | 14.1800 | 76.00 | NA | 15.70000 | 2191.440 | NA | 2334.50 | 340 | 1519.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Graptemys | nigrinoda | NA | NA | 3104.585 | 5.750000 | 3.000000 | 415.70 | 36.94167 | NA | NA | NA | NA | 10.6000 | 72.00 | NA | 26.40000 | 1643.580 | NA | 415.70 | NA | 415.70 | 23.78 | 37.03 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2191.440 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Graptemys | oculifera | NA | Ringed Map Turtle | 2921.920 | 7.500000 | 2.000000 | 918.15 | 36.94167 | NA | NA | NA | NA | 10.1800 | 60.00 | NA | 32.50000 | 1643.580 | NA | 918.15 | NA | 918.15 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Graptemys | ouachitensis | NA | NA | 2556.680 | 10.250000 | 3.000000 | 1306.50 | 35.40000 | NA | NA | NA | NA | 9.7600 | 60.00 | NA | 32.50000 | 1278.340 | NA | 1306.50 | NA | 1306.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Graptemys | pearlensis | NA | NA | NA | 6.400000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Graptemys | pseudogeographica | NA | pseudogeographica: False Map Turtle | 2921.920 | 10.500000 | 3.000000 | 1477.00 | 35.40000 | NA | NA | NA | NA | 9.7600 | 60.00 | NA | 33.72083 | 1826.200 | NA | 1477.00 | NA | 1477.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Graptemys | pulchra | NA | Alabama Map Turtle | 5113.360 | 6.000000 | 2.000000 | 1519.00 | 19.96667 | NA | NA | NA | NA | 14.1800 | 76.00 | NA | 15.70000 | 2921.920 | NA | 1519.00 | NA | 1519.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Graptemys | versa | NA | Texas Map Turtle | 2739.300 | 8.000000 | 3.000000 | 1477.00 | 35.40000 | NA | NA | NA | NA | 9.7600 | 60.00 | NA | 33.72083 | 1278.340 | NA | 1477.00 | NA | 1477.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Malaclemys | terrapin | NA | NA | 2190.000 | 8.500000 | 1.500000 | 803.00 | 14.10000 | NA | NA | 5.80 | NA | 8.3600 | 84.50 | NA | 11.70000 | 910.000 | NA | 886.00 | NA | 886.00 | 21.16 | 29.23 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 1643.625 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Pseudemys | alabamensis | NA | Alabama Redbelly Turtle | 4017.640 | 12.000000 | 2.000000 | 3477.00 | 4.30000 | NA | NA | 7.80 | NA | 11.9000 | 72.50 | NA | 4.30000 | 3287.160 | NA | 3238.50 | NA | 3477.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 3287.160 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Pseudemys | concinna | NA | Eastern River Cooter | 2374.060 | 16.800000 | 2.000000 | 2992.00 | 44.00000 | NA | NA | NA | NA | 12.0950 | 83.00 | NA | 40.31667 | 1277.000 | NA | 2992.00 | NA | 2992.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Pseudemys | gorzugi | NA | Western River Cooter | 2374.060 | 15.000000 | 2.000000 | 2992.00 | 44.00000 | NA | NA | NA | NA | 12.0950 | 83.00 | NA | 40.31667 | 1277.000 | NA | 2992.00 | NA | 2992.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Pseudemys | nelsoni | NA | NA | 2921.920 | 14.500000 | 3.000000 | 3748.50 | 26.10000 | NA | NA | 7.80 | NA | 11.0650 | 72.50 | NA | 15.80000 | 2191.440 | NA | 3738.50 | NA | 3748.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 3287.160 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Pseudemys | peninsularis | NA | Peninsula Cooter | 2374.060 | 15.000000 | 2.000000 | 3065.50 | 12.50000 | NA | NA | 8.50 | NA | 12.2900 | 90.00 | NA | 12.50000 | 1095.720 | NA | 3065.50 | NA | 3065.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Pseudemys | rubriventris | NA | Northern Red-bellied Turtle, Eastern Redbelly Turtle | 4017.640 | 14.500000 | 2.000000 | 3477.00 | 4.30000 | NA | NA | 7.80 | NA | 11.9000 | 72.50 | NA | 4.30000 | 3287.160 | NA | 3238.50 | NA | 3477.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 3287.160 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Pseudemys | texana | NA | Texas River Cooter | 2374.090 | 13.250000 | 2.000000 | 2992.00 | 44.00000 | NA | NA | NA | NA | 12.0950 | 83.00 | NA | 40.31667 | 1186.375 | NA | 2992.00 | NA | 2992.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Terrapene | carolina | NA | NA | 2556.680 | 4.000000 | 1.000000 | 372.00 | 138.00000 | NA | NA | NA | NA | 9.9100 | 55.00 | NA | 50.00000 | 2190.000 | NA | 372.00 | NA | 372.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 1826.225 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Terrapene | coahuila | NA | Coahuilan box turtle | NA | 3.800000 | 2.000000 | 259.80 | 18.80000 | NA | NA | NA | NA | 5.6800 | 52.00 | NA | 18.80000 | NA | NA | 259.80 | NA | 259.80 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Terrapene | mexicana | NA | NA | 2373.340 | 4.000000 | 1.000000 | 855.50 | 138.00000 | NA | NA | NA | NA | 9.9100 | 55.00 | NA | 50.00000 | 2190.000 | NA | 372.00 | NA | 372.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 1826.225 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Terrapene | nelsoni | NA | NA | NA | 2.700000 | NA | 372.00 | 24.90000 | NA | NA | NA | NA | 18.4600 | NA | NA | 24.90000 | NA | NA | 372.00 | NA | 372.00 | 27.00 | 47.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Terrapene | ornata | NA | NA | 2922.000 | 4.000000 | 1.500000 | 394.50 | 80.00000 | 56.50 | NA | NA | NA | 10.2950 | 60.00 | NA | 31.00000 | 2920.000 | NA | 391.00 | NA | 391.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 3104.625 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | callirostris | NA | NA | 2920.000 | 9.700000 | 2.000000 | 1895.00 | 75.00000 | 75.00 | NA | NA | NA | 11.4400 | 65.43 | NA | 27.62500 | 1460.000 | NA | 1854.00 | 900 | 1922.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.750 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | decorata | NA | Hispanolan Slider | NA | 12.000000 | NA | 2522.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 16.0000 | 70.50 | NA | NA | NA | NA | 2522.00 | NA | 2522.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | decussata | NA | Cuban Slider, North Antillean Slider | NA | 5.000000 | NA | 630.10 | NA | NA | NA | NA | NA | 13.3000 | NA | NA | NA | NA | NA | 630.10 | NA | 630.10 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | dorbigni | NA | Black-bellied Slider | 2920.000 | 9.700000 | 2.000000 | 1895.00 | 75.00000 | 75.00 | NA | NA | NA | 11.4400 | 67.93 | NA | 29.95000 | 1460.000 | NA | 1854.00 | 900 | 1922.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.750 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | emolli | NA | NA | 2920.000 | 9.350000 | 2.000000 | 1854.00 | 75.00000 | 75.00 | NA | NA | NA | 11.1000 | 65.43 | NA | 27.62500 | 1460.000 | NA | 1813.00 | 900 | 1895.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.750 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | gaigeae | NA | Big Bend Slider | 2920.000 | 9.850000 | 2.000000 | 1895.00 | 75.00000 | 75.00 | NA | NA | NA | 11.4400 | 60.43 | NA | 29.97500 | 1460.000 | NA | 1854.00 | 900 | 1922.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.750 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | grayi | NA | NA | 2920.000 | 9.350000 | 2.000000 | 1854.00 | 75.00000 | 75.00 | NA | NA | NA | 11.1000 | 65.43 | NA | 27.62500 | 1460.000 | NA | 1813.00 | 900 | 1895.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.750 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | nebulosa | NA | NA | 2920.000 | 9.850000 | 2.000000 | 1895.00 | 75.00000 | 75.00 | NA | NA | NA | 11.4400 | 67.93 | NA | 30.00000 | 1460.000 | NA | 1854.00 | 900 | 1922.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.750 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | ornata | NA | Ornate Slider | 2920.000 | 8.400000 | 2.000000 | 1854.00 | 75.00000 | 75.00 | NA | NA | NA | 11.1000 | 60.43 | NA | 27.62500 | 1460.000 | NA | 1813.00 | 900 | 1895.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.750 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | scripta | NA | Pond Slider, scripta: Yellowbelly Slider, elegans: Red-eared Slider, troostii: Cumberland Slider | 2920.000 | 8.400000 | 2.000000 | 1854.00 | 75.00000 | 75.00 | NA | NA | NA | 11.1000 | 67.93 | NA | 29.95000 | 1460.000 | NA | 1813.00 | 900 | 1895.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.750 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | stejnegeri | NA | Puerto Rican Slider | NA | 8.500000 | NA | NA | 8.10000 | NA | NA | NA | NA | NA | 68.00 | NA | 8.10000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | taylori | NA | Cuatro Cienegas Slider | 2920.000 | 9.850000 | 2.000000 | 1895.00 | 75.00000 | 75.00 | NA | NA | NA | 11.4400 | 60.43 | NA | 29.97500 | 1460.000 | NA | 1854.00 | 900 | 1922.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.750 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | terrapen | NA | Jamaican Slider | NA | 4.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 91.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | venusta | NA | NA | 2920.000 | 9.350000 | 2.000000 | 1854.00 | 75.00000 | 75.00 | NA | NA | NA | 11.1000 | 65.43 | NA | 27.62500 | 1460.000 | NA | 1813.00 | 900 | 1895.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.750 |
| Reptilia | Testudines | Emydidae | Trachemys | yaquia | NA | Yaqui Slider | 2920.000 | 9.700000 | 2.000000 | 1895.00 | 75.00000 | 75.00 | NA | NA | NA | 11.4400 | 67.93 | NA | 29.95000 | 1460.000 | NA | 1854.00 | 900 | 1922.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.750 |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Batagur | baska | NA | Batagur; River Terrapin | NA | 26.000000 | 3.000000 | 17900.00 | 21.70000 | NA | NA | 49.25 | NA | 64.5750 | 79.00 | NA | 15.45000 | NA | NA | 17900.00 | NA | 17900.00 | 40.00 | 66.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Batagur | borneoensis | NA | Painted Terrapin, Biuku | 2556.750 | 12.000000 | 2.000000 | 20950.00 | 80.00000 | NA | NA | NA | NA | 70.4000 | 80.00 | NA | 60.00000 | 2556.750 | 0.75 | 16900.00 | NA | 16900.00 | 40.00 | 72.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Batagur | dhongoka | NA | Three-striped Roofed Turtle | NA | 30.000000 | NA | 7270.00 | 6.80000 | NA | NA | NA | NA | 35.2000 | NA | NA | 6.80000 | NA | NA | 7270.00 | NA | 7270.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Batagur | kachuga | NA | Red-crowned Roofed Turtle | NA | 17.000000 | 1.000000 | 21100.00 | NA | NA | NA | 29.30 | NA | 55.3000 | 83.00 | NA | NA | NA | NA | 21100.00 | NA | 21100.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6391.875 |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Batagur | trivittata | NA | Burmese Roofed Turtle | NA | 25.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cuora | amboinensis | NA | Amboina Box Turtle; Southeast Asian Box Turtle | NA | 1.000000 | NA | 1000.00 | 38.20000 | NA | NA | NA | NA | 19.5000 | 62.00 | NA | 38.20000 | NA | NA | 1000.00 | NA | 1000.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cuora | aurocapitata | NA | Yellow-headed Box Turtle | NA | 3.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 66.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cuora | bourreti | NA | Bourret’s Box Turtle | NA | 2.000000 | NA | 499.00 | 19.10000 | NA | NA | NA | NA | 13.8000 | 85.00 | NA | 19.10000 | NA | NA | 499.00 | NA | 499.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cuora | evelynae | NA | Ryukyu Yellow-margined Box Turtle | NA | 2.000000 | NA | 499.00 | 19.10000 | NA | NA | NA | NA | 13.8000 | 93.00 | NA | 19.10000 | NA | NA | 499.00 | NA | 499.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cuora | flavomarginata | NA | Snake-eating Turtle | NA | 2.000000 | NA | 499.00 | 19.10000 | NA | NA | NA | NA | 13.8000 | 93.00 | NA | 19.10000 | NA | NA | 499.00 | NA | 499.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cuora | galbinifrons | NA | Indochinese Box Turtle | NA | 2.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 70.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cuora | mccordi | NA | McCord’s Box Turtle | NA | 1.500000 | NA | 375.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 13.5000 | NA | NA | NA | NA | NA | 375.00 | NA | 375.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cuora | mouhotii | NA | Keeled Box Turtle | NA | 2.500000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 102.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cuora | picturata | NA | Vietnamese Box Turtle | NA | 2.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 70.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cuora | trifasciata | NA | Three-banded Box Turtle | NA | 2.000000 | NA | NA | 31.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 10.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cuora | yunnanensis | NA | Yunnan Box Turtle | NA | 8.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | 7.40 | NA | NA | 66.00 | NA | NA | NA | NA | 850.00 | 375 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cuora | zhoui | NA | Zhou’s Box Turtle | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 85.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cyclemys | dentata | NA | Asian Leaf Turtle | NA | 3.000000 | NA | 1250.00 | 14.70000 | NA | NA | NA | NA | 13.2000 | NA | NA | 11.90000 | NA | NA | 1250.00 | NA | 1250.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Cyclemys | tcheponensis | NA | Stripeneck Leaf Turtle | NA | 12.500000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Geoclemys | hamiltonii | NA | Black Pond turtle; Spotted Pond turtle | NA | 15.500000 | NA | NA | 19.20000 | NA | NA | NA | NA | NA | 75.50 | NA | 16.75000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Geoemyda | japonica | NA | Okinawa Black-breasted Leaf Turtle | NA | 1.000000 | NA | 196.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 6.1500 | 90.00 | NA | NA | NA | NA | 196.00 | NA | 196.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Geoemyda | spengleri | NA | Black-breasted Leaf Turtle | NA | 1.000000 | NA | 196.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 6.1500 | 90.00 | NA | NA | NA | NA | 196.00 | NA | 196.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Hardella | thurjii | NA | Brahminy River Turtle; Crowned River Turtle | NA | NA | NA | NA | 18.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 18.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Heosemys | annandalii | NA | Yellow-headed Temple Turtle | NA | NA | NA | NA | 9.30000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 9.30000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Heosemys | grandis | NA | Giant Asian Pond Turtle | NA | 5.000000 | NA | NA | 29.60000 | NA | NA | NA | NA | NA | 122.00 | NA | 25.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Heosemys | spinosa | NA | Spiny turtle | NA | 1.000000 | NA | 950.00 | 22.90000 | NA | NA | NA | NA | 29.7000 | 106.00 | NA | 9.30000 | NA | NA | 950.00 | NA | 950.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Leucocephalon | yuwonoi | NA | NA | NA | 1.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Malayemys | subtrijuga | NA | (Malayan) Snail-eating Turtle | NA | NA | NA | NA | 14.20000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 14.20000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Mauremys | annamensis | NA | Annam Leaf Turtle | NA | NA | NA | NA | 23.90000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 23.90000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Mauremys | caspica | NA | Caspian Turtle | NA | 12.000000 | NA | NA | 17.60000 | NA | NA | NA | NA | NA | 95.00 | NA | 15.45000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Mauremys | japonica | NA | Japanese Pond Turtle | NA | 6.000000 | NA | 494.20 | 16.20000 | NA | NA | NA | NA | 12.7000 | 70.00 | NA | 16.20000 | NA | NA | 494.20 | NA | 494.20 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Mauremys | leprosa | NA | Mediterranian Turtle | NA | 8.900000 | NA | 608.00 | 24.50000 | NA | NA | NA | NA | 8.3300 | 93.50 | NA | 17.60000 | NA | NA | 608.00 | NA | 608.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2922.000 |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Mauremys | mutica | NA | Yellowpond Turtle | NA | 1.500000 | NA | 319.50 | 22.10000 | NA | NA | NA | NA | 94.3000 | 79.50 | NA | 14.60000 | NA | NA | 319.50 | NA | 319.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Mauremys | nigricans | NA | Redneck Pond Turtle, Kwangtung River Turtle, Black-Necked Pond Turtle | NA | 3.500000 | NA | NA | 18.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | 39.50 | NA | 18.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Mauremys | reevesii | NA | Reeves’ Turtle | NA | 4.000000 | NA | 858.00 | 24.30000 | NA | NA | NA | NA | 13.0000 | 55.00 | NA | 23.85000 | NA | NA | 858.00 | NA | 858.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Mauremys | rivulata | NA | Western Caspian Turtle | NA | 12.000000 | NA | NA | 17.60000 | NA | NA | NA | NA | NA | 95.00 | NA | 15.45000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Mauremys | sinensis | NA | Chinese Striped-necked Turtle, Common thread turtle | NA | 4.500000 | NA | 1241.00 | 22.80000 | NA | NA | NA | NA | 14.7000 | NA | NA | 17.60000 | NA | NA | 1241.00 | NA | 1241.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Melanochelys | tricarinata | NA | Tricarinate Hill Turtle | NA | 2.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 66.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Melanochelys | trijuga | NA | Indian Black Turtle, Indian Pond Terrapin | NA | 4.500000 | NA | 760.00 | 40.00000 | NA | NA | NA | NA | 48.7000 | 125.00 | NA | 40.00000 | NA | NA | 760.00 | NA | 760.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Notochelys | platynota | NA | Malayan Flat-shelled Turtle | NA | NA | NA | NA | 18.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 11.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Orlitia | borneensis | NA | Malayan Giant Turtle, Century Turtle | NA | 12.000000 | NA | 12400.00 | NA | NA | NA | 50.00 | NA | 28.5000 | 151.00 | NA | NA | NA | NA | 12400.00 | NA | 12400.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Pangshura | smithii | NA | Brown-roofed Turtle | NA | 6.700000 | NA | 919.00 | 13.80000 | NA | NA | NA | NA | 12.4100 | 148.00 | NA | 11.80000 | NA | NA | 919.00 | NA | 919.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Pangshura | sylhetensis | NA | Assam Roofed Turtle | NA | 9.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Pangshura | tecta | NA | Indian Roofed Turtle | NA | 7.500000 | NA | NA | 11.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | 70.00 | NA | 11.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Pangshura | tentoria | NA | Indian Tent Turtle | NA | 6.250000 | NA | 1184.00 | 11.00000 | NA | NA | NA | NA | 20.0000 | 70.00 | NA | 11.00000 | NA | NA | 1184.00 | NA | 1184.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Rhinoclemmys | annulata | NA | Brown Wood Turtle | NA | 1.500000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Rhinoclemmys | areolata | NA | Furrowed Wood Turtle | NA | 1.500000 | 3.500000 | 731.50 | 19.30000 | NA | NA | 20.00 | NA | 39.5500 | 68.50 | NA | 19.30000 | NA | NA | 731.50 | NA | 731.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Rhinoclemmys | diademata | NA | Maracaibo Wood Turtle | NA | 2.000000 | NA | 1126.00 | 5.80000 | NA | NA | NA | NA | 47.2000 | 90.00 | NA | 5.80000 | NA | NA | 1126.00 | NA | 1126.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Rhinoclemmys | funerea | NA | Black Wood Turtle | NA | 3.100000 | NA | 946.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 15.0000 | NA | NA | NA | NA | NA | 946.00 | NA | 946.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Rhinoclemmys | melanosterna | NA | Colombian Wood Turtle | NA | 2.000000 | NA | 2700.00 | 5.80000 | NA | NA | NA | NA | 37.4000 | 86.50 | NA | 5.80000 | NA | NA | 2700.00 | NA | 2700.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Rhinoclemmys | nasuta | NA | Large-nosed Wood Turtle, large-nosed wood turtle | NA | 1.000000 | NA | 1284.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 52.7000 | NA | NA | NA | NA | NA | 1284.00 | NA | 1284.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Rhinoclemmys | pulcherrima | NA | Painted Wood Turtle | NA | 3.000000 | NA | NA | 20.40000 | NA | NA | NA | NA | NA | 123.50 | NA | 20.40000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Rhinoclemmys | punctularia | NA | Spotted-legged Turtle | NA | 1.500000 | NA | NA | 5.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | 90.00 | NA | 5.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Rhinoclemmys | rubida | NA | Mexican Spotted Wood Turtle | NA | 1.500000 | NA | NA | 11.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | 84.00 | NA | 11.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Sacalia | bealei | NA | Eyed Turtle, Beal’s Four-Eyed turtle | NA | 3.500000 | NA | NA | 27.30000 | NA | NA | NA | NA | NA | 72.00 | NA | 27.30000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Sacalia | quadriocellata | NA | Four-Eyed Turtle | NA | 2.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 73.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Siebenrockiella | crassicollis | NA | Siamese Temple Turtle, Black Marsh Turtle | NA | 1.300000 | NA | 940.00 | 16.70000 | NA | NA | NA | NA | 19.2000 | 71.90 | NA | 16.70000 | NA | NA | 940.00 | NA | 940.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Geoemydidae | Vijayachelys | silvatica | NA | Cochin Forest Cane Turtle | NA | 2.000000 | NA | 230.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 15.2500 | NA | NA | NA | NA | NA | 230.00 | NA | 230.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Claudius | angustatus | NA | Narrow-bridged Musk Turtle | NA | 4.000000 | NA | 200.00 | 16.10000 | NA | NA | NA | NA | 3.5000 | 123.00 | NA | 16.10000 | NA | NA | 200.00 | NA | 200.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Cryptochelys | acuta | NA | Tabasco Mud Turtle | 3469.875 | 3.000000 | 5.000000 | 266.00 | 44.70000 | NA | NA | NA | NA | 6.2650 | 130.00 | NA | 14.00000 | NA | 1.00 | 266.00 | NA | 266.00 | 16.60 | 31.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Cryptochelys | angustipons | NA | Central American Mud Turtle | NA | 1.500000 | NA | 201.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 11.9400 | NA | NA | NA | NA | NA | 201.00 | NA | 201.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Cryptochelys | creaseri | NA | Creaser’s Mud Turtle | NA | 1.000000 | NA | 207.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 8.9000 | NA | NA | NA | NA | NA | 207.00 | NA | 207.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Cryptochelys | dunni | NA | Colombian Mud Turtle | NA | 2.000000 | NA | 496.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 15.9000 | NA | NA | NA | NA | NA | 496.00 | NA | 496.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Cryptochelys | herrerai | NA | Herrara’s Mud Turtle | NA | 2.000000 | NA | 486.00 | 19.50000 | NA | NA | NA | NA | 6.9500 | NA | NA | 19.50000 | NA | NA | 486.00 | NA | 486.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Cryptochelys | leucostomum | NA | White-lipped Mud Turtle | NA | 1.000000 | NA | 373.00 | 19.20000 | NA | NA | NA | NA | 9.1200 | 140.00 | NA | 18.45000 | NA | NA | 373.00 | NA | 373.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Kinosternon | alamosae | NA | Alamos Mud Turtle | NA | 4.000000 | NA | 145.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 3.6600 | NA | NA | NA | NA | NA | 145.00 | NA | 145.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Kinosternon | arizonense | NA | Arizona Mud Turtle | 3287.200 | 4.700000 | 1.000000 | 331.15 | 39.93333 | 76.10 | NA | NA | NA | 4.8400 | 117.50 | NA | 12.65000 | 2008.875 | NA | 271.30 | NA | 271.30 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.680 |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Kinosternon | baurii | NA | Striped Mud Turtle | 1826.225 | 2.550000 | 3.000000 | 143.00 | 49.91667 | NA | NA | 3.00 | NA | 4.4500 | 116.00 | NA | 49.60000 | 690.000 | NA | 143.00 | NA | 143.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Kinosternon | chimalhuaca | NA | Jalisco Mud Turtle | 3104.540 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Kinosternon | durangoense | NA | Durango Mud Turtle | 3469.820 | 4.780000 | 1.000000 | 331.15 | 39.93333 | 76.10 | NA | NA | NA | 4.8400 | 102.00 | NA | 12.65000 | 2008.875 | NA | 271.30 | NA | 271.30 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.680 |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Kinosternon | flavescens | NA | Yellow Mud Turtle | 3469.820 | 4.780000 | 1.000000 | 331.15 | 39.93333 | 76.10 | NA | NA | NA | 4.8400 | 102.00 | NA | 12.65000 | 2008.875 | NA | 271.30 | NA | 271.30 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.680 |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Kinosternon | hirtipes | NA | NA | 2556.710 | 3.500000 | 4.000000 | 202.60 | NA | NA | NA | NA | NA | 4.8200 | 198.50 | NA | NA | NA | NA | 202.60 | NA | 202.60 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Kinosternon | integrum | NA | Mexican Mud Turtle | NA | 5.000000 | 3.000000 | 474.40 | 18.50000 | NA | NA | NA | NA | 6.6400 | 102.00 | NA | 18.50000 | NA | NA | 474.40 | NA | 474.40 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Kinosternon | scorpioides | NA | NA | 3469.875 | 3.000000 | 5.000000 | 266.00 | 44.70000 | NA | NA | NA | NA | 6.2650 | 130.00 | NA | 14.00000 | NA | 1.00 | 266.00 | NA | 266.00 | 16.60 | 31.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Kinosternon | sonoriense | NA | NA | 2556.680 | 4.925000 | 3.000000 | 326.00 | 39.93333 | NA | NA | 2.55 | NA | 5.2200 | NA | NA | 32.22500 | 2191.440 | NA | 326.00 | NA | 326.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2556.750 |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Kinosternon | subrubrum | NA | NA | 1825.625 | 3.000000 | 1.100000 | 154.70 | 45.92500 | 76.00 | NA | 3.45 | NA | 4.0900 | 90.66 | NA | 40.00000 | 1460.500 | NA | 152.35 | NA | 152.35 | 16.35 | 24.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 1826.200 |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Staurotypus | salvinii | NA | Chiapas Giant Musk Turtle | NA | 5.360000 | NA | 900.00 | 26.30000 | NA | NA | NA | NA | 10.5700 | 163.50 | NA | 19.00000 | NA | NA | 900.00 | NA | 900.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Staurotypus | triporcatus | NA | Mexican Giant Musk Turtle | NA | 10.000000 | NA | 4200.00 | 33.50000 | NA | NA | NA | NA | 16.2400 | 114.00 | NA | 26.65000 | NA | NA | 4200.00 | NA | 4200.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Sternotherus | carinatus | NA | Razorback Musk Turtle | 2191.440 | 4.200000 | 2.500000 | 248.00 | 29.30000 | NA | NA | 3.50 | NA | 5.7800 | 109.00 | NA | 21.40000 | 2191.440 | NA | 248.00 | NA | 248.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Sternotherus | depressus | NA | Flattened Musk Turtle | 2920.000 | 2.730000 | 3.000000 | 144.00 | 60.00000 | NA | NA | 3.00 | NA | 5.2700 | 106.00 | NA | 23.90000 | 1570.575 | NA | 144.00 | NA | 144.00 | NA | 32.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Sternotherus | minor | NA | Loggerhead Musk Turtle | 2920.000 | 3.000000 | 3.000000 | 154.50 | 23.90000 | NA | NA | 3.00 | NA | 5.2350 | 106.00 | NA | 23.90000 | 1570.075 | NA | 154.50 | NA | 154.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Kinosternidae | Sternotherus | odoratus | NA | Common Musk Turtle, Stinkpot Turtle | 1916.840 | 3.025000 | 3.500000 | 137.90 | 54.90833 | NA | NA | NA | NA | 3.3500 | 62.00 | NA | 54.80000 | 1277.000 | NA | 137.90 | NA | 137.90 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Pelomedusidae | Pelomedusa | subrufa | NA | Helmeted Turtle, Marsh terrapin | NA | 15.000000 | NA | 2273.00 | 20.10000 | NA | NA | NA | NA | 12.3800 | 40.00 | NA | 16.40000 | NA | NA | 2273.00 | NA | 2273.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Pelomedusidae | Pelusios | adansonii | NA | Adanson’s Turtle | NA | 7.000000 | NA | NA | 4.70000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 4.70000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Pelomedusidae | Pelusios | bechuanicus | NA | Okavango Mud Turtle | NA | 34.500000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Pelomedusidae | Pelusios | castaneus | NA | African Mud Turtle | NA | 12.000000 | NA | NA | 47.00000 | NA | NA | NA | NA | 12.9000 | 57.00 | NA | 29.30000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Pelomedusidae | Pelusios | castanoides | NA | Yellowbelly Mud Turtle (castanoides: East African Yellowbelly Mud Turtle; intergularis: Seychelles Yellowbelly Mud Turtle) | NA | 18.000000 | NA | 800.00 | 47.00000 | NA | NA | NA | NA | 10.8500 | 57.00 | NA | 29.30000 | NA | NA | 800.00 | NA | 800.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Pelomedusidae | Pelusios | chapini | NA | Central African Mud Turtle | NA | 12.000000 | NA | NA | 47.00000 | NA | NA | NA | NA | 12.9000 | 57.00 | NA | 29.30000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Pelomedusidae | Pelusios | nanus | NA | African Dwarf Mud Turtle, Dwarf hinged terrapin | NA | 5.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 67.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Pelomedusidae | Pelusios | niger | NA | West African Black Forest Turtle | NA | 11.000000 | NA | NA | 14.70000 | NA | NA | NA | NA | NA | 65.00 | NA | 10.25000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Pelomedusidae | Pelusios | rhodesianus | NA | Variable Mud Turtle, Rhodesian Mud Turtle, Mashona hinged terrapin | NA | 12.500000 | NA | 900.00 | 47.00000 | NA | NA | NA | NA | 11.1500 | 57.00 | NA | 29.30000 | NA | NA | 900.00 | NA | 900.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Pelomedusidae | Pelusios | sinuatus | NA | (East African) Serrated Turtle | NA | 23.500000 | NA | NA | 8.20000 | NA | NA | NA | NA | NA | 56.50 | NA | 7.15000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Pelomedusidae | Pelusios | subniger | NA | East African Black Mud Turtle, Black-bellied hinged terrapin | NA | 12.000000 | NA | NA | 47.00000 | NA | NA | NA | NA | 12.9000 | 57.00 | NA | 29.30000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Pelomedusidae | Pelusios | upembae | NA | Upemba Mud Turtle, Upemba hinged terrapin | NA | 34.500000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Pelomedusidae | Pelusios | williamsi | NA | Williams’ African Mud Turtle | NA | 12.500000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 71.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Platysternidae | Platysternon | megacephalum | NA | Big-headed Turtle | NA | 2.500000 | NA | NA | 27.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 21.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Podocnemididae | Erymnochelys | madagascariensis | NA | Madagascan Big-headed Side-necked Turtle | NA | 22.000000 | 2.000000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 66.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Podocnemididae | Peltocephalus | dumerilianus | NA | Big-headed Amazon River Turtle | NA | 10.700000 | NA | 3600.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 46.6000 | 117.00 | NA | NA | NA | NA | 3600.00 | NA | 3600.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Podocnemididae | Podocnemis | erythrocephala | NA | Red-headed Amazon Side-necked Turtle | NA | 7.850000 | NA | NA | 18.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | 66.80 | NA | 18.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Podocnemididae | Podocnemis | expansa | NA | Arrau River Turtle, South American River Turtle | NA | 91.500000 | 1.000000 | 25800.00 | 50.00000 | NA | NA | 27.90 | NA | 37.2000 | NA | NA | 32.65000 | NA | NA | 25800.00 | NA | 25800.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2008.875 |
| Reptilia | Testudines | Podocnemididae | Podocnemis | lewyana | NA | Rio Magdalena River Turtle | NA | 16.500000 | NA | 9599.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 23.1000 | NA | NA | NA | NA | NA | 9599.00 | NA | 9599.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Podocnemididae | Podocnemis | sextuberculata | NA | Six-tubercled Amazon River Turtle, Amazon River Turtle | NA | 37.500000 | 1.000000 | 14.30 | 50.00000 | NA | NA | 27.90 | NA | 37.2000 | 88.00 | NA | 25.30000 | NA | NA | 25800.00 | NA | 25800.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 1826.250 |
| Reptilia | Testudines | Podocnemididae | Podocnemis | unifilis | NA | Yellow-spotted Amazon River Turtle | NA | 24.000000 | NA | 4500.00 | 70.00000 | NA | NA | NA | NA | 24.4000 | 68.25 | NA | 39.40000 | NA | NA | 6380.00 | NA | 6380.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2008.875 |
| Reptilia | Testudines | Podocnemididae | Podocnemis | vogli | NA | Savanna Side-necked Turtle | NA | 13.500000 | NA | 2013.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 18.4200 | 125.00 | NA | NA | NA | NA | 2013.00 | NA | 2013.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 3652.500 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Aldabrachelys | gigantea | NA | Aldabra Giant Tortoise | 9131.250 | 13.500000 | 2.000000 | 117200.00 | 176.00000 | 7396.92 | NA | NA | NA | 80.8000 | 130.50 | NA | 152.00000 | 9131.250 | 0.75 | 33000.00 | NA | 70050.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 9679.125 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Astrochelys | radiata | NA | Radiated Tortoise | NA | 5.000000 | 3.000000 | 10217.00 | 99.83333 | NA | NA | NA | NA | 61.0000 | 172.50 | NA | 12.80000 | NA | NA | 7955.00 | NA | 10217.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6574.500 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Astrochelys | yniphora | NA | Madagascan (Plowshare or Ploughshare) Tortoise | 7305.000 | 4.298013 | 4.000000 | 8000.00 | 100.00000 | 237.00 | NA | 24.50 | NA | 45.0000 | 239.00 | NA | 75.00000 | 7305.000 | NA | 8800.00 | 10300 | 8000.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 5478.600 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Chelonoidis | abingdonii | NA | NA | NA | 10.000000 | 3.333382 | 175000.00 | 177.00000 | NA | NA | NA | NA | 119.7500 | 112.00 | NA | 70.00000 | NA | NA | NA | NA | 168050.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 7305.000 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Chelonoidis | becki | NA | Volcan Wolf Giant Tortoise, Cape Berkeley Giant Tortoise | NA | 10.000000 | 3.333382 | 175000.00 | 177.00000 | NA | NA | NA | NA | 119.7500 | 112.00 | NA | 70.00000 | NA | NA | NA | NA | 168050.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 7305.000 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Chelonoidis | carbonarius | NA | Red-footed Tortoise | 1826.250 | 5.709832 | 3.499790 | 2000.00 | 49.00000 | NA | NA | 26.00 | NA | 41.8500 | 150.50 | NA | 49.00000 | 1826.250 | NA | NA | NA | 2000.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Chelonoidis | chathamensis | NA | Chatham Island Giant Tortoise | NA | 10.000000 | 3.333382 | 175000.00 | 177.00000 | NA | NA | NA | NA | 119.7500 | 112.00 | NA | 70.00000 | NA | NA | NA | NA | 168050.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 7305.000 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Chelonoidis | chilensis | NA | Argentine tortoise | NA | 3.000000 | 2.000000 | 3181.00 | 19.80000 | NA | NA | NA | NA | 34.3000 | 365.14 | NA | 19.80000 | NA | NA | 3181.00 | NA | 3181.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 4383.000 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Chelonoidis | darwini | NA | James Island Giant Tortoise | NA | 10.000000 | 3.333382 | 175000.00 | 177.00000 | NA | NA | NA | NA | 119.7500 | 112.00 | NA | 70.00000 | NA | NA | NA | NA | 168050.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 7305.000 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Chelonoidis | denticulatus | NA | Yellow-footed Tortoise | NA | 6.500000 | NA | NA | 70.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | 136.98 | NA | 35.20000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Chelonoidis | duncanensis | NA | Duncan Island Giant Tortoise | NA | NA | NA | NA | 177.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 177.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Chelonoidis | hoodensis | NA | Hood Island Giant Tortoise | NA | 10.000000 | 3.333382 | 175000.00 | 177.00000 | NA | NA | NA | NA | 119.7500 | 112.00 | NA | 70.00000 | NA | NA | NA | NA | 168050.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 7305.000 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Chelonoidis | niger | NA | Charles Island Giant Tortoise | NA | 10.000000 | 3.333382 | 175000.00 | 177.00000 | NA | NA | NA | NA | 119.7500 | 112.00 | NA | 70.00000 | NA | NA | NA | NA | 168050.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 7305.000 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Chelonoidis | porteri | NA | Indefatigable Island Giant Tortoise | NA | 10.000000 | 3.333382 | 175000.00 | 177.00000 | NA | NA | NA | NA | 119.7500 | 112.00 | NA | 70.00000 | NA | NA | NA | NA | 168050.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 7305.000 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Chelonoidis | vicina | NA | NA | NA | 10.000000 | 3.333382 | 175000.00 | 177.00000 | NA | NA | NA | NA | 119.7500 | 112.00 | NA | 70.00000 | NA | NA | NA | NA | 168050.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 7305.000 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Chersina | angulata | NA | South African Bowsprit Tortoise, Angulate Tortoise | NA | 1.000000 | 3.083838 | 715.00 | 11.80000 | NA | NA | NA | NA | 27.7500 | 124.38 | NA | 11.80000 | NA | 1.00 | 715.00 | NA | 691.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 3652.500 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Geochelone | elegans | NA | Star Tortoise | 3650.000 | 5.290357 | 2.209685 | 4225.00 | 24.30000 | NA | NA | 18.70 | NA | 28.0000 | 138.50 | NA | 24.30000 | NA | NA | 2500.00 | 2500 | 4850.00 | 34.40 | 41.40 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Geochelone | platynota | NA | Burmese Star Tortoise | 3650.000 | 5.290357 | 2.209685 | 4225.00 | 24.30000 | NA | NA | 18.70 | NA | 28.0000 | 138.50 | NA | 24.30000 | NA | NA | 2500.00 | 2500 | 4850.00 | 34.40 | 41.40 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Geochelone | sulcata | NA | African Spurred Tortoise | NA | 17.000000 | 2.750095 | 43000.00 | 54.30000 | NA | NA | 25.00 | NA | 44.0000 | 145.00 | NA | 54.30000 | NA | NA | 22400.00 | NA | 43533.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Gopherus | agassizii | NA | Agassiz’s Desert Tortoise, (Californian) Desert Tortoise | 5500.000 | 5.892097 | 2.000000 | 2784.00 | 62.80000 | 118.00 | NA | 32.90 | NA | 35.9500 | 89.00 | NA | 40.00000 | 4575.000 | NA | 2443.00 | NA | 1845.00 | NA | 41.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 5478.675 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Gopherus | berlandieri | NA | Texas (Gopher )Tortoise | 3651.250 | 2.800000 | 1.000000 | 1792.00 | 60.00000 | NA | NA | 32.90 | NA | 33.9000 | 91.32 | NA | 27.85000 | 3650.000 | NA | 1769.50 | NA | 1769.50 | NA | 41.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 4857.825 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Gopherus | flavomarginatus | NA | Mexican Gopher Tortoise | NA | 5.200000 | 1.300000 | NA | 4.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | 90.00 | NA | 4.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6391.775 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Gopherus | polyphemus | NA | (Florida) Gopher Tortoise | 3650.000 | 6.600000 | 1.000000 | 4142.00 | 60.00000 | NA | NA | 32.90 | NA | 40.9500 | 90.00 | NA | 32.50000 | 3650.000 | NA | 2784.00 | NA | 2784.00 | NA | 41.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 5478.750 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Homopus | areolatus | NA | Parrot-beaked Tortoise | NA | 2.877778 | 1.000000 | 229.40 | 28.60000 | NA | NA | NA | NA | 8.9700 | 107.50 | NA | 17.95000 | NA | 1.00 | 289.40 | NA | 229.20 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Homopus | boulengeri | NA | Donner-weer Tortoise | NA | 1.000000 | 1.000000 | 177.10 | NA | NA | NA | NA | NA | 10.8950 | NA | NA | NA | NA | 1.00 | 213.00 | NA | 177.05 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Homopus | femoralis | NA | Greater padloper, Karroo Tortoise | NA | 2.000000 | 1.000000 | 393.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 9.9950 | NA | NA | NA | NA | 1.00 | 599.00 | NA | 393.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Homopus | signatus | NA | Speckled Cape Tortoise, Speckled Padloper | NA | 1.000000 | 1.000000 | 151.40 | NA | NA | NA | NA | NA | 11.3400 | NA | NA | NA | NA | 1.00 | NA | NA | 151.40 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Indotestudo | elongata | NA | Elongated Tortoise | NA | 4.000000 | 2.499750 | 1150.00 | 14.10000 | NA | NA | NA | NA | 47.0000 | 150.00 | NA | 12.95000 | NA | NA | 255.00 | NA | 2045.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Indotestudo | forstenii | NA | Travancore Tortoise, Forsten’s Tortoise, Celebes Tortoise | NA | 4.000000 | 2.499750 | 1680.00 | 32.90000 | NA | NA | NA | NA | 44.9000 | 150.00 | NA | 23.50000 | NA | NA | 967.50 | NA | 1862.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Indotestudo | travancorica | NA | Travancore Tortoise | NA | 4.000000 | 2.499750 | 1150.00 | 14.10000 | NA | NA | NA | NA | 47.0000 | 150.00 | NA | 11.80000 | NA | NA | 255.00 | NA | 2045.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Kinixys | belliana | NA | Bell’s Hingeback Tortoise | NA | 2.300000 | NA | 1202.00 | 26.50000 | NA | NA | NA | NA | 36.0800 | 121.50 | NA | 22.00000 | NA | NA | 1202.00 | NA | 1202.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Kinixys | erosa | NA | Eroded Hingeback Tortoise | NA | 2.500000 | NA | NA | 24.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 24.80000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Kinixys | homeana | NA | Home’s Hingeback Tortoise | NA | 3.000000 | 1.500000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 95.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 790.80 | 35.00 | 46.00 | NA | NA | NA | NA | 4.45 | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Kinixys | lobatsiana | NA | Lobatse Hingeback Tortoise | NA | 2.300000 | NA | 1202.00 | 26.50000 | NA | NA | NA | NA | 36.0800 | 121.50 | NA | 22.00000 | NA | NA | 1202.00 | NA | 1202.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Kinixys | natalensis | NA | Natal Hingeback Tortoise | NA | 2.300000 | NA | 1202.00 | 26.50000 | NA | NA | NA | NA | 36.0800 | 121.50 | NA | 22.00000 | NA | NA | 1202.00 | NA | 1202.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Kinixys | nogueyi | NA | Bell’s Hingeback Tortoise | NA | 2.300000 | NA | 1202.00 | 26.50000 | NA | NA | NA | NA | 36.0800 | 121.50 | NA | 22.00000 | NA | NA | 1202.00 | NA | 1202.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Kinixys | spekii | NA | Spek’s Hinged-back tortoise, Speke’s Hingeback Tortoise | NA | 3.500000 | NA | 640.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Kinixys | zombensis | NA | Bell’s Hingeback Tortoise | NA | 2.300000 | NA | 1202.00 | 26.50000 | NA | NA | NA | NA | 36.0800 | 121.50 | NA | 22.00000 | NA | NA | 1202.00 | NA | 1202.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Malacochersus | tornieri | NA | Pancake Tortoise | NA | 1.000000 | 1.000000 | 391.25 | 25.90000 | NA | NA | NA | NA | 18.8800 | 152.20 | NA | 25.90000 | NA | 1.00 | 400.00 | NA | 391.25 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Manouria | emys | NA | Brown Tortoise | NA | 39.000000 | 1.000000 | 26000.00 | 150.00000 | 73.50 | NA | NA | NA | 57.0000 | 66.00 | NA | 19.90000 | NA | NA | NA | NA | 26000.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Manouria | impressa | NA | Impressed Tortoise | NA | 13.500000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 3200.00 | 2500 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Psammobates | geometricus | NA | Geometric Tortoise | NA | 3.500000 | 1.000000 | 443.75 | 30.00000 | NA | NA | NA | NA | 10.2600 | NA | NA | 30.00000 | NA | 1.00 | 366.80 | 680 | 443.75 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 2648.062 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Psammobates | oculiferus | NA | Serrated Tortoise | NA | 1.000000 | 1.000000 | 317.90 | NA | NA | NA | NA | NA | 16.4300 | NA | NA | NA | NA | 1.00 | NA | NA | 317.90 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Psammobates | tentorius | NA | Tent Tortoise | NA | 1.376923 | 1.000000 | 423.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 10.6050 | NA | NA | NA | NA | 1.00 | 423.00 | NA | 455.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Pyxis | arachnoides | NA | Madagascan Spider Tortoise | NA | 1.000000 | 1.000000 | 301.20 | NA | NA | NA | NA | NA | 13.4600 | 235.00 | NA | NA | NA | 1.00 | NA | NA | 301.20 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 4382.880 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Pyxis | planicauda | NA | Madagascan Flat-tailed Tortoise | 3652.400 | 1.165714 | 3.000000 | 573.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 17.7500 | 295.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 573.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Stigmochelys | pardalis | NA | Leopard Tortoise | NA | 8.670000 | NA | 20000.00 | 100.00000 | 365.28 | NA | 25.00 | NA | 59.5800 | 160.00 | NA | 30.00000 | 2008.875 | 1.00 | 20000.00 | NA | 20000.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 4930.875 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Testudo | graeca | NA | Mediterranean Spur-thighed Tortoise | 4605.000 | 5.000000 | 3.200993 | 1430.00 | 127.00000 | NA | NA | 10.80 | NA | 14.2000 | 78.00 | NA | 127.00000 | 4560.000 | NA | 1430.00 | NA | 2612.00 | 27.97 | 33.87 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 4383.000 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Testudo | hermanni | NA | Hermann’s Tortoise | 4650.000 | 4.500000 | 1.666118 | 1249.00 | 127.00000 | NA | NA | 8.00 | NA | 14.4000 | 68.00 | NA | 40.00000 | 4560.000 | NA | 1280.00 | NA | 1430.00 | 27.97 | 33.87 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 4382.880 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Testudo | horsfieldii | NA | Horsfield’s Tortoise | NA | 4.000000 | 3.000000 | 1018.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 17.7500 | 75.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 1018.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 3652.500 |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Testudo | kleinmanni | NA | Egyptian Tortoise (werneri: Negev Tortoise) | 2191.500 | 1.666667 | 3.000000 | 440.00 | 40.00000 | NA | NA | 5.90 | NA | 11.2000 | 101.00 | NA | 28.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Testudinidae | Testudo | marginata | NA | Marginated Tortoise | NA | 6.500000 | 2.399096 | 1918.00 | 21.20000 | NA | NA | NA | NA | 17.7000 | 79.00 | NA | 21.20000 | NA | NA | 2080.00 | NA | 1756.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 5113.360 |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Amyda | cartilaginea | NA | Black-rayed Soft-shelled Turtle, Asiatic Softshell Turtle | NA | 17.000000 | NA | NA | 7.30000 | NA | NA | NA | NA | NA | 137.50 | NA | 7.30000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Apalone | ferox | NA | Florida Softshell Turtle | NA | 22.000000 | 6.000000 | 23463.00 | 36.75000 | 68.00 | NA | 9.70 | NA | 13.0400 | 63.00 | NA | 26.20000 | NA | NA | 20000.00 | 700 | 3326.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 3287.520 |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Apalone | mutica | NA | Smooth Softshelled Turtle | 2556.680 | 12.200000 | 2.500000 | 819.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 7.0600 | 61.93 | NA | NA | NA | NA | 819.00 | NA | 819.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Apalone | spinifera | NA | NA | 3285.000 | 18.000000 | 1.500000 | 4765.00 | 50.00000 | NA | NA | NA | NA | 9.4650 | 60.00 | NA | 25.20000 | 3285.000 | NA | 4765.00 | NA | 4765.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Chitra | indica | NA | Narrow-headed soft-shelled Turtle | NA | 102.000000 | 1.000000 | 108000.00 | NA | NA | NA | 8.50 | NA | 15.2000 | 55.00 | NA | NA | NA | NA | 108000.00 | NA | 108000.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Cyclanorbis | senegalensis | NA | Senegal Soft-shelled Turtle | NA | NA | NA | NA | 6.40000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 6.40000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Cycloderma | frenatum | NA | Zambezi Soft-shelled Turtle | NA | 18.000000 | 1.000000 | 14591.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 17.9000 | 289.18 | NA | NA | NA | NA | 14591.00 | NA | 14591.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Lissemys | punctata | NA | Indian Flap-shelled Turtle | NA | 10.500000 | NA | 1444.50 | 17.80000 | NA | NA | NA | NA | 10.8850 | 57.50 | NA | 15.30000 | NA | NA | 1444.50 | NA | 1444.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Lissemys | scutata | NA | Burmese Flap-shelled Turtle | NA | 10.500000 | NA | 1444.50 | 17.80000 | NA | NA | NA | NA | 10.8850 | 57.50 | NA | 15.30000 | NA | NA | 1444.50 | NA | 1444.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Nilssonia | gangetica | NA | Ganges Soft-shelled Turtle | NA | 30.200000 | NA | 19000.00 | 14.00000 | NA | NA | NA | NA | 25.3000 | NA | NA | 14.00000 | NA | NA | 19000.00 | NA | 19000.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Nilssonia | nigricans | NA | Black Soft-shelled Turtle, Bostami Turtle | NA | 20.200000 | NA | 6971.00 | NA | NA | NA | NA | NA | 26.0000 | NA | NA | NA | NA | NA | 6971.00 | NA | 6971.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Palea | steindachneri | NA | Wattle-necked Soft-shelled Turtle | NA | 15.500000 | NA | NA | 41.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 41.00000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Pelochelys | bibroni | NA | Asian or Bibron’s Giant soft-shelled Turtle | NA | 26.000000 | NA | NA | 10.10000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 10.10000 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Pelodiscus | sinensis | NA | Chinese Soft-shelled Turtle | NA | 14.500000 | NA | 2327.50 | 7.30000 | NA | NA | NA | NA | 5.4000 | 61.50 | NA | 7.30000 | NA | NA | 2327.50 | NA | 2327.50 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| Reptilia | Testudines | Trionychidae | Trionyx | triunguis | NA | Nile Soft-shelled Turtle | NA | 40.000000 | NA | 10818.00 | 50.60000 | NA | NA | 11.80 | NA | 17.8200 | 64.50 | NA | 37.90000 | NA | NA | 10818.00 | NA | 10818.00 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
IUCN Spatial Data
I also used the IUCN Red List Spatial Data to access a large data frame with a comprehensive assessment of threats to various taxonomic groups. The data did not have a server URL file nor was in .csv format for use of the download.file command. To download the spatial data for reptiles, I visited this website. The main dataset for reptiles was downloaded into the downloads folder of my personal computer, where it was then moved and unzipped in my Spatial Data folder which was put on the gitignite list due to sheer size. For reproducibility, I then wrote it into a .csv and deposited it into my repository on GitHub. The data was then unpacked using the taxize package, which required an IUCN Red List API. The application is at http://apiv3.iucnredlist.org/api/v3/token. Once I did, with the help of the rredlist package, the data frame contained 273 observations, representing the same number of unique species. It also had 2 variables: the binomial and the iucn category. Being that I used pipes for this step, I also loaded tidyverse, which includes dplyr.
## Including spatial information into the data frame
Turtle_status<-read.csv("./Data/Base/Turtle_status.csv")
## Data summary
kable(cbind(Turtle_status), "html") %>%
kable_styling() %>%
scroll_box(width = "500px", height = "500px")| X | Binomial | iucn |
|---|---|---|
| 1 | Carettochelys insculpta | VU |
| 2 | Acanthochelys pallidipectoris | EN |
| 3 | Acanthochelys spixii | NT |
| 4 | Chelodina canni | NA |
| 5 | Chelodina expansa | NA |
| 6 | Chelodina longicollis | NA |
| 7 | Chelodina mccordi | CR |
| 8 | Chelodina novaeguineae | LC |
| 9 | Chelodina oblonga | NT |
| 10 | Chelodina parkeri | VU |
| 11 | Chelodina reimanni | NT |
| 12 | Chelus fimbriatus | NA |
| 13 | Elseya albagula | NA |
| 14 | Elseya dentata | NA |
| 15 | Elseya irwini | NA |
| 16 | Elseya lavarackorum | NA |
| 17 | Elseya novaeguineae | LC |
| 18 | Emydura macquarii | NA |
| 19 | Emydura subglobosa | LC |
| 20 | Emydura tanybaraga | NA |
| 21 | Flaviemys purvisi | NA |
| 22 | Hydromedusa maximiliani | VU |
| 23 | Hydromedusa tectifera | NA |
| 24 | Mesoclemmys dahli | CR |
| 25 | Mesoclemmys gibba | NA |
| 26 | Mesoclemmys nasuta | NA |
| 27 | Mesoclemmys tuberculata | NA |
| 28 | Mesoclemmys vanderhaegei | NT |
| 29 | Mesoclemmys zuliae | VU |
| 30 | Myuchelys bellii | NA |
| 31 | Myuchelys georgesi | NA |
| 32 | Myuchelys latisternum | NA |
| 33 | Phrynops geoffroanus | NA |
| 34 | Phrynops hilarii | NA |
| 35 | Phrynops tuberosus | NA |
| 36 | Phrynops williamsi | NA |
| 37 | Platemys platycephala | NA |
| 38 | Pseudemydura umbrina | CR |
| 39 | Rheodytes leukops | VU |
| 40 | Rhinemys rufipes | NT |
| 41 | Caretta caretta | VU |
| 42 | Chelonia mydas | EN |
| 43 | Eretmochelys imbricata | CR |
| 44 | Lepidochelys kempii | CR |
| 45 | Lepidochelys olivacea | VU |
| 46 | Natator depressus | DD |
| 47 | Chelydra acutirostris | NA |
| 48 | Chelydra rossignonii | VU |
| 49 | Chelydra serpentina | LC |
| 50 | Macrochelys temminckii | VU |
| 51 | Dermatemys mawii | CR |
| 52 | Dermochelys coriacea | VU |
| 53 | Actinemys marmorata | VU |
| 54 | Chrysemys dorsalis | NA |
| 55 | Chrysemys picta | LC |
| 56 | Clemmys guttata | EN |
| 57 | Deirochelys reticularia | NA |
| 58 | Emydoidea blandingii | EN |
| 59 | Emys orbicularis | NT |
| 60 | Glyptemys insculpta | EN |
| 61 | Glyptemys muhlenbergii | CR |
| 62 | Graptemys barbouri | VU |
| 63 | Graptemys caglei | EN |
| 64 | Graptemys ernsti | NT |
| 65 | Graptemys flavimaculata | VU |
| 66 | Graptemys geographica | LC |
| 67 | Graptemys gibbonsi | EN |
| 68 | Graptemys nigrinoda | LC |
| 69 | Graptemys oculifera | VU |
| 70 | Graptemys ouachitensis | LC |
| 71 | Graptemys pearlensis | EN |
| 72 | Graptemys pseudogeographica | LC |
| 73 | Graptemys pulchra | NT |
| 74 | Graptemys versa | LC |
| 75 | Malaclemys terrapin | NT |
| 76 | Pseudemys alabamensis | EN |
| 77 | Pseudemys concinna | LC |
| 78 | Pseudemys gorzugi | NT |
| 79 | Pseudemys nelsoni | LC |
| 80 | Pseudemys peninsularis | LC |
| 81 | Pseudemys rubriventris | NT |
| 82 | Pseudemys texana | LC |
| 83 | Terrapene carolina | VU |
| 84 | Terrapene coahuila | EN |
| 85 | Terrapene mexicana | NA |
| 86 | Terrapene nelsoni | DD |
| 87 | Terrapene ornata | NT |
| 88 | Trachemys callirostris | NA |
| 89 | Trachemys decorata | VU |
| 90 | Trachemys decussata | NA |
| 91 | Trachemys dorbigni | NA |
| 92 | Trachemys emolli | NA |
| 93 | Trachemys gaigeae | VU |
| 94 | Trachemys grayi | NA |
| 95 | Trachemys nebulosa | NA |
| 96 | Trachemys ornata | VU |
| 97 | Trachemys scripta | LC |
| 98 | Trachemys stejnegeri | NT |
| 99 | Trachemys taylori | EN |
| 100 | Trachemys terrapen | VU |
| 101 | Trachemys venusta | NA |
| 102 | Trachemys yaquia | VU |
| 103 | Batagur baska | CR |
| 104 | Batagur borneoensis | CR |
| 105 | Batagur dhongoka | EN |
| 106 | Batagur kachuga | CR |
| 107 | Batagur trivittata | EN |
| 108 | Cuora amboinensis | VU |
| 109 | Cuora aurocapitata | CR |
| 110 | Cuora bourreti | CR |
| 111 | Cuora evelynae | NA |
| 112 | Cuora flavomarginata | EN |
| 113 | Cuora galbinifrons | CR |
| 114 | Cuora mccordi | CR |
| 115 | Cuora mouhotii | EN |
| 116 | Cuora picturata | CR |
| 117 | Cuora trifasciata | CR |
| 118 | Cuora yunnanensis | CR |
| 119 | Cuora zhoui | CR |
| 120 | Cyclemys dentata | NT |
| 121 | Cyclemys tcheponensis | NA |
| 122 | Geoclemys hamiltonii | VU |
| 123 | Geoemyda japonica | EN |
| 124 | Geoemyda spengleri | EN |
| 125 | Hardella thurjii | VU |
| 126 | Heosemys annandalii | EN |
| 127 | Heosemys grandis | VU |
| 128 | Heosemys spinosa | EN |
| 129 | Leucocephalon yuwonoi | CR |
| 130 | Malayemys subtrijuga | VU |
| 131 | Mauremys annamensis | CR |
| 132 | Mauremys caspica | NA |
| 133 | Mauremys japonica | NT |
| 134 | Mauremys leprosa | NA |
| 135 | Mauremys mutica | EN |
| 136 | Mauremys nigricans | EN |
| 137 | Mauremys reevesii | EN |
| 138 | Mauremys rivulata | NA |
| 139 | Mauremys sinensis | EN |
| 140 | Melanochelys tricarinata | VU |
| 141 | Melanochelys trijuga | NT |
| 142 | Notochelys platynota | VU |
| 143 | Orlitia borneensis | EN |
| 144 | Pangshura smithii | NT |
| 145 | Pangshura sylhetensis | EN |
| 146 | Pangshura tecta | LC |
| 147 | Pangshura tentoria | LC |
| 148 | Rhinoclemmys annulata | NT |
| 149 | Rhinoclemmys areolata | NT |
| 150 | Rhinoclemmys diademata | NA |
| 151 | Rhinoclemmys funerea | NT |
| 152 | Rhinoclemmys melanosterna | NA |
| 153 | Rhinoclemmys nasuta | NT |
| 154 | Rhinoclemmys pulcherrima | NA |
| 155 | Rhinoclemmys punctularia | NA |
| 156 | Rhinoclemmys rubida | NT |
| 157 | Sacalia bealei | EN |
| 158 | Sacalia quadriocellata | EN |
| 159 | Siebenrockiella crassicollis | VU |
| 160 | Vijayachelys silvatica | EN |
| 161 | Claudius angustatus | NT |
| 162 | Cryptochelys acuta | NA |
| 163 | Cryptochelys angustipons | NA |
| 164 | Cryptochelys creaseri | NA |
| 165 | Cryptochelys dunni | NA |
| 166 | Cryptochelys herrerai | NA |
| 167 | Cryptochelys leucostomum | NA |
| 168 | Kinosternon alamosae | DD |
| 169 | Kinosternon arizonense | LC |
| 170 | Kinosternon baurii | LC |
| 171 | Kinosternon chimalhuaca | LC |
| 172 | Kinosternon durangoense | DD |
| 173 | Kinosternon flavescens | LC |
| 174 | Kinosternon hirtipes | LC |
| 175 | Kinosternon integrum | LC |
| 176 | Kinosternon scorpioides | NA |
| 177 | Kinosternon sonoriense | NT |
| 178 | Kinosternon subrubrum | LC |
| 179 | Staurotypus salvinii | NT |
| 180 | Staurotypus triporcatus | NT |
| 181 | Sternotherus carinatus | LC |
| 182 | Sternotherus depressus | CR |
| 183 | Sternotherus minor | LC |
| 184 | Sternotherus odoratus | LC |
| 185 | Pelomedusa subrufa | NA |
| 186 | Pelusios adansonii | NA |
| 187 | Pelusios bechuanicus | NA |
| 188 | Pelusios castaneus | NA |
| 189 | Pelusios castanoides | LC |
| 190 | Pelusios chapini | NA |
| 191 | Pelusios nanus | NA |
| 192 | Pelusios niger | NA |
| 193 | Pelusios rhodesianus | LC |
| 194 | Pelusios sinuatus | NA |
| 195 | Pelusios subniger | LC |
| 196 | Pelusios upembae | DD |
| 197 | Pelusios williamsi | NA |
| 198 | Platysternon megacephalum | EN |
| 199 | Erymnochelys madagascariensis | CR |
| 200 | Peltocephalus dumerilianus | VU |
| 201 | Podocnemis erythrocephala | VU |
| 202 | Podocnemis expansa | NT |
| 203 | Podocnemis lewyana | CR |
| 204 | Podocnemis sextuberculata | VU |
| 205 | Podocnemis unifilis | VU |
| 206 | Podocnemis vogli | NA |
| 207 | Aldabrachelys gigantea | NA |
| 208 | Astrochelys radiata | CR |
| 209 | Astrochelys yniphora | CR |
| 210 | Chelonoidis abingdonii | EX |
| 211 | Chelonoidis becki | VU |
| 212 | Chelonoidis carbonarius | NA |
| 213 | Chelonoidis chathamensis | EN |
| 214 | Chelonoidis chilensis | VU |
| 215 | Chelonoidis darwini | CR |
| 216 | Chelonoidis denticulatus | NA |
| 217 | Chelonoidis duncanensis | VU |
| 218 | Chelonoidis hoodensis | CR |
| 219 | Chelonoidis niger | EX |
| 220 | Chelonoidis porteri | CR |
| 221 | Chelonoidis vicina | EN |
| 222 | Chersina angulata | LC |
| 223 | Geochelone elegans | VU |
| 224 | Geochelone platynota | CR |
| 225 | Geochelone sulcata | NA |
| 226 | Gopherus agassizii | VU |
| 227 | Gopherus berlandieri | LC |
| 228 | Gopherus flavomarginatus | VU |
| 229 | Gopherus polyphemus | VU |
| 230 | Homopus areolatus | LC |
| 231 | Homopus boulengeri | NT |
| 232 | Homopus femoralis | LC |
| 233 | Homopus signatus | VU |
| 234 | Indotestudo elongata | EN |
| 235 | Indotestudo forstenii | EN |
| 236 | Indotestudo travancorica | VU |
| 237 | Kinixys belliana | NA |
| 238 | Kinixys erosa | DD |
| 239 | Kinixys homeana | VU |
| 240 | Kinixys lobatsiana | LC |
| 241 | Kinixys natalensis | NT |
| 242 | Kinixys nogueyi | NA |
| 243 | Kinixys spekii | NA |
| 244 | Kinixys zombensis | NA |
| 245 | Malacochersus tornieri | VU |
| 246 | Manouria emys | EN |
| 247 | Manouria impressa | VU |
| 248 | Psammobates geometricus | CR |
| 249 | Psammobates oculiferus | NA |
| 250 | Psammobates tentorius | LC |
| 251 | Pyxis arachnoides | CR |
| 252 | Pyxis planicauda | CR |
| 253 | Stigmochelys pardalis | LC |
| 254 | Testudo graeca | VU |
| 255 | Testudo hermanni | NT |
| 256 | Testudo horsfieldii | VU |
| 257 | Testudo kleinmanni | CR |
| 258 | Testudo marginata | LC |
| 259 | Amyda cartilaginea | VU |
| 260 | Apalone ferox | LC |
| 261 | Apalone mutica | LC |
| 262 | Apalone spinifera | LC |
| 263 | Chitra indica | EN |
| 264 | Cyclanorbis senegalensis | VU |
| 265 | Cycloderma frenatum | EN |
| 266 | Lissemys punctata | LC |
| 267 | Lissemys scutata | DD |
| 268 | Nilssonia gangetica | VU |
| 269 | Nilssonia nigricans | EW |
| 270 | Palea steindachneri | EN |
| 271 | Pelochelys bibroni | VU |
| 272 | Pelodiscus sinensis | VU |
| 273 | Trionyx triunguis | VU |
The data frame contained IUCN categories that existed prior to the 2001 system, the one that is relevant for this study. Because these categories remained, it required the renaming of old categories.
table(Turtle_status$iucn)##
## CR DD EN EW EX LC NT VU
## 33 7 37 1 2 42 30 52Categories “Near Threatened” and “Least Concern” became their own categories while “Conservation Dependent” was merged into “Near Threatened”.
## To rename outdated categories
Turtle_status$iucn[which(Turtle_status$iucn=="LR/cd")]<-"NT"
Turtle_status$iucn[which(Turtle_status$iucn=="LR/nt")]<-"NT"
Turtle_status$iucn[which(Turtle_status$iucn=="LR/lc")]<-"LC"
table(Turtle_status$iucn)##
## CR DD EN EW EX LC NT VU
## 33 7 37 1 2 42 30 52GBIF Occurrence Data
I also used the GBIF occurrence data to be able to graphically analyze the geographic patterns of turtles. Due to the size of this dataframe, I added it to my gitignore. The dataframe contained 348,778 observations with 184 variables for 273 species of turtles. I used pipes here as well, and needed the tidyverse package to do so.
#gbif_records<-read.csv("Data/Base/gbif_records2.csv")I then cleaned many of the variables, being that many in the data frame were beyond the scope of this project.
#gbif_records<-
#gbif_records %>%
#dplyr::filter(!is.na(lon)&!is.na(lat))%>%
#dplyr::select(lon, lat, species, country) This yielded a data frame still with 204,747 occurrences but with only 4 variables. These variables are lon, lat, species, country.
#names(gbif_records)After this, I removed the duplicate occurences in the data frame, yielding 82,837 observations for 4 variables for 273 species of turtles.
## Get rid of duplicate occurrences
#dups=duplicated(gbif_records[, c("lon", "lat", "country")])
#gbif_records <-gbif_records[!dups, ]Merging
At this stage the data has been cleaned for the purposes of this project. The next step is combining the data into one data frame for it to be usable during analysis. I then wrote this file into a .csv.
## Create a "binomial" column because data frames must be merged on a name they both have.
#Testudines$Binomial<-paste(Testudines$genus,Testudines$species)
## To merge the turtle amniote data and iucn data
#Turtle_Lifehistory_df<-merge(Testudines, Turtle_status, by.x="Binomial")
## To merge the previous merger with gbif records
#All_Dataframes_df<-merge(Turtle_Lifehistory_df, gbif_records, by.x="Binomial", by.y="species")Results and Discussion
Data description
## Load data
All_Dataframes_df<-read.csv("./Data/Processed/Clean_Turtle_Lifehistory_Data.csv")
## Data description
kable(cbind(head(All_Dataframes_df)), "html") %>%
kable_styling() %>%
scroll_box(width = "600px", height = "400px")| X | Binomial | class | order | family | genus | species | subspecies | common_name | female_maturity_d | litter_or_clutch_size_n | litters_or_clutches_per_y | adult_body_mass_g | maximum_longevity_y | gestation_d | weaning_d | birth_or_hatching_weight_g | weaning_weight_g | egg_mass_g | incubation_d | fledging_age_d | longevity_y | male_maturity_d | inter_litter_or_interbirth_interval_y | female_body_mass_g | male_body_mass_g | no_sex_body_mass_g | egg_width_mm | egg_length_mm | fledging_mass_g | adult_svl_cm | male_svl_cm | female_svl_cm | birth_or_hatching_svl_cm | female_svl_at_maturity_cm | female_body_mass_at_maturity_g | no_sex_svl_cm | no_sex_maturity_d | iucn | lon | lat | country |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Acanthochelys pallidipectoris | Reptilia | Testudines | Chelidae | Acanthochelys | pallidipectoris | NA | Chaco Side-necked Turtle | NA | 3.5 | NA | 369.2 | NA | NA | NA | NA | NA | 10.3413 | NA | NA | NA | NA | NA | 369.2 | NA | 369.2 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | EN | -60.35998 | -22.46506 | Paraguay |
| 2 | Acanthochelys pallidipectoris | Reptilia | Testudines | Chelidae | Acanthochelys | pallidipectoris | NA | Chaco Side-necked Turtle | NA | 3.5 | NA | 369.2 | NA | NA | NA | NA | NA | 10.3413 | NA | NA | NA | NA | NA | 369.2 | NA | 369.2 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | EN | -60.38032 | -28.54493 | Argentina |
| 3 | Acanthochelys pallidipectoris | Reptilia | Testudines | Chelidae | Acanthochelys | pallidipectoris | NA | Chaco Side-necked Turtle | NA | 3.5 | NA | 369.2 | NA | NA | NA | NA | NA | 10.3413 | NA | NA | NA | NA | NA | 369.2 | NA | 369.2 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | EN | -60.43879 | -26.79118 | Argentina |
| 4 | Acanthochelys pallidipectoris | Reptilia | Testudines | Chelidae | Acanthochelys | pallidipectoris | NA | Chaco Side-necked Turtle | NA | 3.5 | NA | 369.2 | NA | NA | NA | NA | NA | 10.3413 | NA | NA | NA | NA | NA | 369.2 | NA | 369.2 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | EN | -64.40137 | -16.27710 | Bolivia |
| 5 | Acanthochelys pallidipectoris | Reptilia | Testudines | Chelidae | Acanthochelys | pallidipectoris | NA | Chaco Side-necked Turtle | NA | 3.5 | NA | 369.2 | NA | NA | NA | NA | NA | 10.3413 | NA | NA | NA | NA | NA | 369.2 | NA | 369.2 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | EN | -58.97517 | -27.46181 | Argentina |
| 6 | Acanthochelys pallidipectoris | Reptilia | Testudines | Chelidae | Acanthochelys | pallidipectoris | NA | Chaco Side-necked Turtle | NA | 3.5 | NA | 369.2 | NA | NA | NA | NA | NA | 10.3413 | NA | NA | NA | NA | NA | 369.2 | NA | 369.2 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | EN | -60.20167 | -29.36111 | Argentina |
Data distribution
## Get map with maptools package
data(wrld_simpl)
## Color vector with RColorBrewer package
cols<-brewer.pal(n=n_distinct(All_Dataframes_df$iucn),name="Set1")
cols_status<-cols[All_Dataframes_df$iucn]
## To plot map and get turtle distribution
plot(wrld_simpl, xlim=c(min(All_Dataframes_df$lon)-1,max(All_Dataframes_df$lon)+1), ylim=c(min(All_Dataframes_df$lat)-1,max(All_Dataframes_df$lat)+1), axes=TRUE, col="light cyan")
points(All_Dataframes_df$lon, All_Dataframes_df$lat, col=cols_status, pch=16, cex=0.75)
legend("top",fill=cols,legend = levels(All_Dataframes_df$iucn),horiz=TRUE)
## Creating a background map with leaflet package
## Create a color palette by factor:
mypalette = colorFactor( palette="YlOrBr", domain=All_Dataframes_df$iucn, na.color="transparent")
## Prepare the text for the tooltip:
mytext=paste("Status: ", All_Dataframes_df$iucn, "<br/>", "Species: ", All_Dataframes_df$Binomial, "<br/>", "Bodymass (g): ", All_Dataframes_df$adult_body_mass_g, sep="") %>%
lapply(htmltools::HTML)
## Final Map
leaflet(All_Dataframes_df) %>%
addTiles() %>%
addProviderTiles("Esri.WorldImagery") %>%
addCircleMarkers(~lon, ~lat,
fillColor = ~mypalette(iucn), fillOpacity = 0.7, color="white", radius=3, stroke=FALSE,
label = mytext,
labelOptions = labelOptions( style = list("font-weight" = "normal", padding = "3px 8px"), textsize = "13px", direction = "auto")
) %>%
addLegend( pal=mypalette, values=~iucn, opacity=0.9, title = "IUCN Status", position = "bottomright" )Data analysis
In order to demonstrate the relationship between the body mass (g) life history trait to the IUCN category, we drew a box and whisker plot.
## Boxplot showing log mean weight against IUCN status. Used ggplot2 package.
All_Dataframes_df %>%
group_by(Binomial) %>%
dplyr::summarise(Weight_avg=mean(adult_body_mass_g, na.rm=TRUE),
status_iucn=unique(iucn)) %>%
ggplot(aes(x=status_iucn,y=log(Weight_avg), fill=status_iucn))+
geom_boxplot(alpha=0.3)+
theme(legend.position = "none")+
ylab("Log Body Mass (g)") +
xlab("IUCN Status")
We see somewhat of a relationship in this scatterplot. It appears that turtles that are of a larger body mass lay larger eggs. This may point towards a larger initial energy investment in offspring, moreso since larger turtles have larger clutch sizes. Furthermore, we see some occurrence of more critical categories (CR, VU, EN) with larger turtles that invest much in their eggs.
## Relationship between log adult body mass and log egg mass among turtles
ggplot(All_Dataframes_df,aes(x=log(adult_body_mass_g), y=log(egg_mass_g))) +
geom_point(aes(colour=iucn, size=litter_or_clutch_size_n), alpha=0.8) +
ylab("Log Egg Mass (g)") +
xlab("Log Adult Body Mass (g)")
Waples et al. (2016) highlighted the importance of adult turtle mortality and population sizes. I used this as inspiration to probe the potential of an even stronger relationship between a life-history trait and extinction rates. I used the maximum longevity variable.
ggplot(All_Dataframes_df, aes(x=iucn, y=maximum_longevity_y, fill=iucn)) +
geom_boxplot(alpha=0.3) +
theme(legend.position="none")+
ylab("Maximum Longevity (years)") +
xlab("IUCN Status")## Warning: Removed 2147 rows containing non-finite values (stat_boxplot).
We see promising data in this scatterplot in that the longer-lived turtles appear to fall under more severe IUCN categories. Egg mass is also correlated to longer-lived turtles, and so is the clutch size. The six marine turtles in the world are some of the heaviest, and follow patterns similar to those displayed here. Furthermore, they often lay hundreds of eggs in a single clutch.
ggplot(All_Dataframes_df,aes(x=maximum_longevity_y, y=log(egg_mass_g))) +
geom_point(aes(colour=iucn, size=litter_or_clutch_size_n), alpha=0.8) +
ylab("Log Egg Mass (g)") +
xlab("Maximum Longevity (years)")## Warning: Removed 5084 rows containing missing values (geom_point).
It appears that life-history extinction rate correlates in turtles lie in both body mass and longevity. Conservation efforts must thus focus on preemtively identifying turtles that could become at risk based on these life-history traits.
References
Bonin, F., Devaux, B., & Dupré, A. (2006). Turtles of the World. JHU Press.
Cooper, N., Bielby, J., Thomas, G. H., & Purvis, A. (2008). Macroecology and extinction risk correlates of frogs. Global Ecology and Biogeography, 17(2), 211-221.
Frazer, N. B. (1992). Sea turtle conservation and halfway technology. Conservation Biology, 6(2), 179-184.
GBIF.org (29th February 2016) GBIF Occurrence Download https://doi.org/10.15468/dl.ywhpmz
Haitao, S., Parham, J. F., Lau, M., & Tien-Hsi, C. (2007). Farming endangered turtles to extinction in China. Conservation Biology, 21(1), 5-6.
IUCN 2017. IUCN Red List of Threatened Species. Version 2017-3 <www.iucnredlist.org>
Spotila, J. R., Reina, R. D., Steyermark, A. C., Plotkin, P. T., & Paladino, F. V. (2000). Pacific leatherback turtles face extinction. Nature, 405(6786), 529.
van Dijk, P. P., Stuart, B. L., & Rhodin, A. G. (2000). Asian Turtle Trade: Proceedings of a Workshop on Conservation and Trade of Freshwater Turtles and Tortoises in Asia–Phnom Penh, Cambodia, 1-4 December 1999. Lunenburg, Mass.: Chelonian Research Foundation.
Waples, R. S. (2016). Life-history traits and effective population size in species with overlapping generations revisited: the importance of adult mortality. Heredity, 117(4), 241.